离心喷雾干燥机干燥物料对离开干燥室的废气中夹带的细粉产品，必须有效地加以分离及回收，以保证干燥产品的回收率，防止细粉逸到大气中造成环境污染。可以采用干法或湿法回收设备。干法回收的物料可以送到下一加工工序或包装车间。湿法回收的物料可以送到进料的预处理部分循环使用或作为废料处理。干法回收设备（如旋风分离器、袋滤器或静电除尘器等）用于第一级的分离及回收。一般不会影响产品的质量，但通过旋风分离器时，那些脆性物料会被破碎而减小粒度。如果在离开第一级分离设备的废气中，还存在微量细粉料，而且必须在除尘后才能将废气排入大气的，就要湿法除尘设备（如湿式洗涤器、湿旋流分离器、冲洗风机等）用作第二级的分离回收。一般情况下，从洗涤器出来的液体浓度太低，进行浓缩和干燥是不经济的，因此，只能送到废水处理处。

旋风分离器的应用比较广泛，这是因为它的成本低，而且维护简单。一般来说，旋风分离器的分离效率对大多数喷雾干燥产品是足够高的，可以不用第二级收集设备。但应该注意，无论其效率有多高，即使在最佳的操作条件下，旋风分离器的效率也达不到100%。如果要求分离完全，就应该选用其他分离设备，例如袋滤器的效率基本上有达到100%的可能，但采用这样一个设备就能把不含尘的废气排到大气中的优点，会被其维修及清扫等方面的困难拉平。如果袋夹安装不正而使布袋破裂或漏料，要进行修复是很困难的。在充满粉尘的环境中检查布袋的完整情况以及使破袋脱离工作，是一件艰苦而费时的任务，而且会造成长时间停机（从清洁的观点考虑，目前还是采用袋滤器来回收粉尘）。

为了选择最合适的分离系统，应从产品的粒度、结构、废气中粉料含量、气体流量、要求的分离效率、可利用的动力以及厂房空间等各个方面的因素综合考虑。如果全部产品由气流带出干燥室，粉料含量就很高，就要求采用一组高效率的旋风分离器来处理，以达到较高的回收效率。当然，即使分离效率达到99.5%，在大产量情况下，产品损失还是很客观的。如果必须将干料完全回收，就应在旋风分离器（组）的后面配置袋滤器或用袋滤器完全代替旋风分离器。如果采用部分粉料从干燥室底部排出的方法，就只有比较细的一部分干料由废气带入分离系统。采用袋滤器可以将细料全部回收。采用旋风分离器时，由于含尘量低，颗粒又细，分离效率一般只有90%～96%。虽然细料在全部成品中占的比例并不大，如果不在旋风分离器的后面加上其他分离装置，物料损失还是不容忽视的。

严格的硬性规定倒也没有。如果制品容重特别小（如蛋白粉等），或成品价值很高（如染料等），或对大气环境污染严重（如农药对环境的植被破坏性很大），就应在旋风分离器后面装上袋滤器或湿式洗涤器，以保证极少粉尘逸出。即使大部分物料从干燥室底部排出，只有很少量的粉料进入分离系统，也应这样安排布置。如果大部分产品从干燥室底部排出（即主排放），则在干燥系统中，就会有几处进行排粉。为了便于产品包装，通常将各处排出的干粉汇集到一个共同的风机或机械输送系统中。

由离心喷雾干燥机干燥室底部及旋风分离器底部将干粉排到一个共同的风送系统送到一个旋风分离器分离下来进行包装。风送空气可以直接排入大气或回到喷雾干燥系统中。风送空气回流进入干燥空气的共同排气系统的情况。也可以将这部分空气送回到干燥室。输送到料仓或进一步加工，或直接送到包装车间。虽然这种系统避免了处理风送空气的问题，但操作环境的粉尘较大。在卫生条件稍有要求的地方，是不能考虑这种方法的。皮带输送系统多用于化学工业中。